被跨國大藥企重金下注的“黑暗基因組”，潛力有多大？

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作者：葉楓紅來源：葉楓紅

2023-10-23

近些年的研究發(fā)現(xiàn)，黑暗基因組中隱藏了很多重要的調節(jié)性元件，能夠控制大量基因的活性，而且這些元件在多種疾病發(fā)生中也扮演著非常關鍵的角色。大多數(shù)導致復雜免疫和過敏性疾病易感性的遺傳變異都集中在黑暗基因組中，比如多發(fā)性硬化癥、狼瘡和類風濕性關節(jié)炎等。

黑暗基因組

2022年10月，Nucleome Therapeutics宣布完成4240萬美元的A輪融資，此次融資由M Ventures牽頭，強生的戰(zhàn)略風險投資部門JJDC（強生創(chuàng)新）、輝瑞風投等參投。資金將用于推進公司的自身免疫性疾病項目，推動暗基因圖譜的拓展，以及其開創(chuàng)性平臺的開發(fā)。

今年9月，ROME Therapeutics完成了7200萬美元B+輪融資。此次B+輪融資除了孵化機構GV及老股東ARCH Venture Partners等的追加投資外，ROME此次還獲得了強生創(chuàng)新、BMS及賽諾菲風投的青睞。

什么是黑暗基因組（Dark genome）？

黑暗基因組又稱基因組"暗物質"，即指基因組中的非編碼RNA，指在人類基因組中不直接編碼蛋白質的DNA，約占人類基因組的98%。黑暗基因組主要由病毒樣重復元件和非編碼序列等組成。這些重復序列包括長散在重復元件LINEs (long interspersed elements; 約占人類基因組的21%)、短散在重復元件 SINES (short interspersed elements; 約占人類基因組的 15%)、人類內源性逆轉錄病毒序列HERVs (human endogenous retroviruses, 約占人類基因組的9%)等。

探索黑暗基因組功能的公司

Nucleome Therapeutics

Nucleome Therapeutics創(chuàng)立于2019年，是一家致力于解碼人類基因組暗物質中的遺傳變異，以尋找治療疾病新療法的生物科技公司。

2021年5月，Nucleome Therapeutics在《自然》雜志上發(fā)表了一種新型的3D基因組分析方法。該方法被稱為Micro Capture-C（MCC）。這項技術可以讓團隊從三維角度，觀察DNA在細胞中的折疊情況，幫助解開人類基因組暗物質中的基因變體，最終找到用藥的候選靶點。

Nucleome Therapeutics的研究重點在于淋巴細胞和相關的自身免疫性疾病，其目標是建立一個強大的藥物資產(chǎn)管線。

CAMP4 Therapeutics

2022年7月20日，專注于開發(fā)可編程療法的生物技術公司CAMP4 Therapeutics宣布完成1億美元的B輪融資，用于其針對監(jiān)管RNA的平臺，該平臺用于解碼黑暗基因組。

本輪融資由Patient Square Capital領投，Gaingels與現(xiàn)有投資者5AM Ventures、Polaris Partners、Northpond Ventures、Kraft Group和Andreessen Horowitz跟投。

CAMP4 Therapeutics開發(fā)的調節(jié)RNA（regRNA）驅動平臺技術能夠在所有細胞種類中，發(fā)現(xiàn)與控制蛋白表達基因相關的regRNA圖譜，并開發(fā)可編程的反義寡核苷酸（ASO）靶向這些regRNA，以協(xié)助基因的上調，最終達到治療疾病的效果。

Omega Therapeutics

Omega Therapeutics創(chuàng)立于2017年，是一家處于臨床前階段的生物技術公司，致力于使用DNA序列靶向、mRNA編碼療法來調控基因的表達。公司正在通過專有平臺Omega開發(fā)多條管線，旨在針對不同的EpiZips開發(fā)對應的OEC，調控不同基因的表達，從而達到治療、保健等醫(yī)學目的。

Omega Therapeutics于2021年7月在美國納斯達克上市。公司致力于將研發(fā)藥物用于傳統(tǒng)方式未能成功解決的特定疾病，包括某些腫瘤適應癥、肝病、嚴重炎癥、急性呼吸窘迫綜合征（ARDS）等。

Rome Therapeutics

Rome Therapeutics于2020年創(chuàng)立，由谷歌旗下風投機構 Google Ventures（GV）投資并孵化建立。Rome Therapeutics的藥物研發(fā)重點集中于人類黑暗基因組。 Rome Therapeutics研發(fā)管線中的其他項目側重于腫瘤學，即靶向表達高水平重復衍生抗原和重復誘導基因組不穩(wěn)定性的癌細胞，以及神經(jīng)退行性疾病。

今年9月12日，Rome Therapeutics宣布完成7200萬美元B輪融資，用于將其主要候選藥物LINE-1逆轉錄酶（RT）抑制劑推進至臨床測試階段。

LINE-1（Long interspersed nuclear elements）是反轉錄轉座子的一種，是人類基因組中豐度最高的反轉錄轉座子，占據(jù)人類基因組序列的17%左右。人類基因組中包含了數(shù)十萬個LINE-1，它們能夠在基因組中復制和跳躍，還能夠轉錄為LINE-1 RNA，它們會隨著年齡的增長以及包括癌癥和心血管疾病在內的疾病情況而變化，不過目前對LINE-1的功能仍知之甚少。

作為黑暗基因組領域的探路者，這些公司的臨床探索將為其理論提供重要驗證；如果得到臨床證實，其可能為相關疾病領域開啟一條全新的治療路徑，為患者帶來更多的治療選擇。

參考來源：

1. Research from the Lab of CAMP4 Co-Founder Richard Young Shows That RNA Binding to Transcription Factors Fine-Tunes Gene Expression o CAMP4 (camp4tx.com).

2. https://www.globenewswire.com/news-release/2022/10/19/2537043/0/en/Nucleome-Therapeutics-raises-oversubscribed-37-5-million-Series-A-financing-to-decode-the-dark-matter-of-the-human-genome-and-deliver-first-in-class-precision-medicines.html.

3. Drug discovery biotech looking into the 'dark' regions of the human genome picks up a $40M+ Series A，Retrieved Oct 20th, 2022, from https://endpts.com/drug-discovery-biotech-looking-into-the-dark-regions-of-the-human-genome-picks-up-a-40m-series-a/.