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被追逐的分子膠,還需要一個(gè)成功的故事

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作者:武月  來源:氨基觀察
  2024-07-05
近幾十年來,隨著結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)千種與疾病相關(guān)的蛋白結(jié)構(gòu),傳統(tǒng)的藥物研發(fā)通過調(diào)控這些蛋白結(jié)構(gòu)和活性來治療疾病。比如小分子抑制劑的經(jīng)典作用模式是“占據(jù)驅(qū)動(dòng)”,通過和蛋白的活性位點(diǎn)或變構(gòu)位點(diǎn)結(jié)合,以廢除該蛋白的功能。但傳統(tǒng)的小分子抑制劑面臨著耐藥突變和難成藥靶點(diǎn)兩大挑戰(zhàn)。

       2023 年 12 月10日,F(xiàn)DA批準(zhǔn)的基因編輯和基因治療鐮狀細(xì)胞病療法上市兩天后,諾華的生物化學(xué)家 Pamela Ting 在美國血液學(xué)會(huì)年會(huì)上做了一份全體報(bào)告。

       Pamela Ting描述了一種表型篩選,該篩選產(chǎn)生的結(jié)果會(huì)導(dǎo)致胎兒血紅蛋白激增,這種蛋白質(zhì)與最近批準(zhǔn)的基因編輯療法經(jīng)過改造后產(chǎn)生的蛋白質(zhì)相同。

       但與售價(jià) 220 萬美元的基因編輯療法不同的是,諾華的化合物是小分子蛋白質(zhì)降解劑,也就是分子膠,其生產(chǎn)和管理成本要低得多。

       3個(gè)月前,諾和諾德宣布了一筆潛在交易總額14.6億美元的合作,加大其在分子膠領(lǐng)域的研發(fā)力度。2023年以來,包括BMS、羅氏、默沙東等大藥企相繼與海外biotech達(dá)成分子膠技術(shù)平臺/項(xiàng)目合作,潛在交易總額超過百億美元。

       分子膠,作為破解傳統(tǒng)小分子藥物耐藥突變及不可成藥難題的利器,又一次站上了風(fēng)口。

       面對巨大的市場空間,國內(nèi)藥企同樣不甘落后。諾誠健華、正大天晴、康樸生物、達(dá)歌生物、格博生物等藥企紛紛布局……

       并且,過去一周,達(dá)歌生物牽手武田,嘉越醫(yī)藥與美國Erasca展開分子膠項(xiàng)目合作;因普那布林上市失敗而陷入困境的萬春醫(yī)藥,則因其子公司SEED的分子膠項(xiàng)目而股價(jià)大漲,自2月份以來漲幅超200%。

       新的競速開始了,所有人都在等待著一個(gè)成功的故事。

       / 01 /

       不可成藥靶點(diǎn)的救贖

       近幾十年來,隨著結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)千種與疾病相關(guān)的蛋白結(jié)構(gòu),傳統(tǒng)的藥物研發(fā)通過調(diào)控這些蛋白結(jié)構(gòu)和活性來治療疾病。比如小分子抑制劑的經(jīng)典作用模式是“占據(jù)驅(qū)動(dòng)”,通過和蛋白的活性位點(diǎn)或變構(gòu)位點(diǎn)結(jié)合,以廢除該蛋白的功能。

       但傳統(tǒng)的小分子抑制劑面臨著耐藥突變和難成藥靶點(diǎn)兩大挑戰(zhàn)。

       根據(jù)2017年NRDD綜述的統(tǒng)計(jì),彼時(shí)FDA批準(zhǔn)的1578個(gè)藥物僅僅靶向了667種靶蛋白,其中小分子藥物靶向了549種,大分子藥物靶向了146種,僅占潛在靶點(diǎn)的1/3。大量潛在靶點(diǎn)受限于小分子藥物的局限性難以開發(fā)藥物。

       正是在這一背景下,靶向蛋白降解(TPD)技術(shù)成為了小分子藥物研發(fā)的一種開創(chuàng)性策略。

       所謂蛋白降解,主要通過誘導(dǎo)致病靶蛋白的快速降解發(fā)揮治療作用。理論上,致病靶點(diǎn)都消失了,不可成藥和耐藥性的問題自然迎刃而解。TPD分為PROTAC和分子膠兩大類。《PROTAC,小分子藥物的“百憂解”?》

       分子膠,顧名思義像膠水一樣的小分子。其工作原理是通過與一種稱為E3泛素連接酶的酶結(jié)合,改變其表面形狀,使其能夠與目標(biāo)蛋白結(jié)合。一旦形成三者結(jié)合,E3連接酶就會(huì)在蛋白質(zhì)中添加一條泛素分子鏈,從而觸發(fā)細(xì)胞的蛋白質(zhì)降解系統(tǒng),將目標(biāo)蛋白質(zhì)分解。

       在傳統(tǒng)的小分子藥物中,藥物與致病靶點(diǎn)結(jié)合占據(jù)了結(jié)合位點(diǎn),使得致病靶點(diǎn)無法正常發(fā)揮作用,而對于不可成藥靶點(diǎn)來說,由于沒有結(jié)合位點(diǎn),傳統(tǒng)小分子藥物則無法與其結(jié)合。

       在細(xì)胞內(nèi)部,很多生理過程是需要靠300000多個(gè)蛋白與蛋白的相互作用完成,比如快速的修飾和調(diào)節(jié),或是快速的合成和降解。

       分子膠正是利用了細(xì)胞內(nèi)天然的過程,迫使原本不會(huì)相互結(jié)合的蛋白質(zhì)與E3連接酶發(fā)生作用,從而實(shí)現(xiàn)對疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的降解。

       如此一來,就解決了藥物靶點(diǎn)不可成藥的難題;由于致病靶點(diǎn)被裂解,自然也不會(huì)存在耐藥性的問題。

       這也是其與PROTAC技術(shù)最有吸引力的地方。而相比分子量較大的PROTAC,通常難以遵守類藥五原則,提高生物利用度、實(shí)現(xiàn)口服給藥往往存在較高的設(shè)計(jì)壁壘,分子膠的分子量較小,某種程度上簡化了PROTAC降解劑的結(jié)構(gòu),具有更好的成藥性,代表性藥物如沙利度胺、來那度胺等。

       / 02 /

       “賭”平臺的MNC

       分子膠降解劑的故事與沙利度胺密切相關(guān)。

       盡管早在90年代分子膠的概念就被提出,但直到2013年,研究人員才闡明了沙利度胺類似物作為分子膠降解劑的作用機(jī)制,這才徹底打開了分子膠領(lǐng)域的大門。

       2014年之后,分子膠降解劑逐漸興起,并逐步發(fā)展成為研發(fā)人員關(guān)注的小分子藥物焦點(diǎn);過去幾年,全球醫(yī)藥圈掀起了一波研發(fā)熱潮,大藥企也相繼入局。

       而與其他領(lǐng)域以引進(jìn)管線為主不同的是,分子膠領(lǐng)域的交易則是以MNC合作開發(fā)/引進(jìn)biotech技術(shù)平臺為主。

       最大的交易來自BMS,其于2019年以740億美元收購Celgene,并獲得了三款“度胺”類上市產(chǎn)品(沙利度胺及其類似物來那度胺和泊馬度胺),以及CC-92480、CC-99282、CC-220等在研管線,一舉穩(wěn)坐分子膠領(lǐng)域頭把交椅。

       去年以來,默沙東、羅氏、諾和諾德先后入局,BMS更是再度加碼。其中,默沙東以總額25.5億美元與分子膠領(lǐng)頭羊之一Proxygen達(dá)成合作,共同開發(fā)分子膠降解劑。后者開發(fā)了一種高度通用的分子膠降解劑發(fā)現(xiàn)引擎,可以推動(dòng)新型分子膠降解劑的規(guī)?;_發(fā),通過結(jié)合基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和藥物化學(xué)等高度跨學(xué)科的方法發(fā)現(xiàn)和開發(fā)新型分子膠降解劑。

       默沙東之前,勃林格殷格翰、德國默克先后與Proxygen達(dá)成合作。羅氏也著手在分子膠領(lǐng)域布局,在不到一個(gè)月的時(shí)間宣布了兩項(xiàng)關(guān)于分子膠技術(shù)平臺的合作。

       擁有分子膠發(fā)現(xiàn)平臺的biotech,正在成為大藥企眼中的香餑餑。

       如果說,過去分子膠賽道的BD更多是發(fā)生在MNC與海外biotech之間,如今國內(nèi)biotech也開始被發(fā)掘。過去一周,嘉越醫(yī)藥與美國Erasca就Pan-RAS(ON) 抑制劑JYP0015達(dá)成全球獨(dú)家授權(quán)協(xié)議;達(dá)歌生物則牽手武田制藥,利用其GlueXplorer平臺,針對武田選定的特定疾病靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、驗(yàn)證和優(yōu)化分子膠降解劑,潛在交易總額最高可達(dá)12億美元。

       MNC之所以不約而同地押注平臺,本質(zhì)是因?yàn)椋肿幽z雖然非常理想,但迄今為止發(fā)現(xiàn)的分子膠水降解劑仍寥寥可數(shù),其發(fā)現(xiàn)過程具有很大的偶然性,缺乏一個(gè)系統(tǒng)的發(fā)現(xiàn)和設(shè)計(jì)策略。因此,大藥企希望押注新的技術(shù)平臺,甚至借助AI技術(shù),加速分子膠的發(fā)現(xiàn)。

       由于巨大的不確定性,大藥企也在這場賭局中保留著理性。

       比如,羅氏去年與分子膠領(lǐng)域明星公司Monte Rosa達(dá)成的總額超20億美元合作,利用其Queen技術(shù)平臺開發(fā)分子膠降解劑。其中,首付款只有5000萬美元,占比僅2.5%。至于BD交易中的其它后續(xù)款項(xiàng),則需要藥企不斷達(dá)到交易前設(shè)立的目標(biāo),才能夠拿到手。

       / 03 /

       需要一個(gè)成功的故事

       無論如何,近兩年在小分子藥物領(lǐng)域,分子膠幾乎成為了最受追捧的賽道。

       但這個(gè)領(lǐng)域,還需要一個(gè)成功的故事。

       截至目前,全球已上市、頗具銷售規(guī)模的分子膠藥并不多,仍停留在三大“度胺”階段。國內(nèi)外企業(yè)雖在積極布局,但多數(shù)還處于臨床階段。而分子膠的臨床研發(fā)并不順利,此前Celgene和Biotheryx 的 GSPT1 降解劑已不再開發(fā);諾華在1期試驗(yàn)后停止了其 IKZF2 降解劑。

       可以說,除了三大“度胺”,該領(lǐng)域仍在等待概念的臨床驗(yàn)證。

       正如前文所說,盡管與PROTAC相比,分子膠體積通常更小,有更好的成藥潛力,但其無法像PROTAC一樣可以通過各組分大規(guī)模篩選獲得,設(shè)計(jì)原理尚不明晰,研發(fā)仍存在不少技術(shù)難點(diǎn)。

       首先,分子膠通過誘導(dǎo)或穩(wěn)定E3泛素連接酶和靶蛋白之間的蛋白相互作用,實(shí)現(xiàn)對靶蛋白的招募和降解,但是,這種三元復(fù)合物的復(fù)雜結(jié)構(gòu)導(dǎo)致分子膠無法用化學(xué)方法直接設(shè)計(jì);

       其次,分子膠需要特定化學(xué)構(gòu)成完成對靶蛋白的選擇性招募,所以缺乏定向設(shè)計(jì)的化合物文庫會(huì)讓分子膠藥物無法進(jìn)行精準(zhǔn)篩選;

       最后,分子膠和靶蛋白的互作需要一系列復(fù)雜的體外和體內(nèi)生物驗(yàn)證,而且分子膠的先導(dǎo)化合物優(yōu)化,及其藥效藥理研究都沒有大量數(shù)據(jù)積累,給藥物的臨床推進(jìn)帶來挑戰(zhàn)。

       如何設(shè)計(jì)分子膠?如何篩選分子膠?如何尋找新的靶點(diǎn)?如何尋找新的E3?如何優(yōu)化分子的特異性?都是有待解答的問題。

       當(dāng)然,隨著技術(shù)的不斷發(fā)展,最近幾年,分子膠藥物設(shè)計(jì)方法正得以優(yōu)化,分子膠化合物庫也在不斷豐富與擴(kuò)大,關(guān)于分子膠的探索正逐步過渡到了理性藥物設(shè)計(jì)階段。比如前文提及的Proxygen。

       除此之外,AI技術(shù)的發(fā)展也為分子膠的突破帶來了機(jī)遇。計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)加快了小分子藥物的開發(fā)進(jìn)度,同樣可以用于TPD領(lǐng)域的藥物研發(fā)。典型如AI分子膠發(fā)現(xiàn)公司VantAI,雖然其成立至今無任何融資信息,也無產(chǎn)品管線,卻先后獲得了楊森、勃林格殷格翰、BMS等MNC的青睞。

       可以說,尋找新的E3,新類型的分子,是PROTAC和分子膠都要走的創(chuàng)新型路線。拿到高結(jié)合力、特異性高的分子,還是需要很多設(shè)計(jì)和篩選,敢于走這樣路線的公司,要么有自己大量的小分子庫,要么有自己的AI算法或是高通量篩選的方法,沒有一定積累的藥企很難突破這一關(guān)。

       缺乏足夠的積累,缺少基礎(chǔ)理論的支撐,缺少分子膠研發(fā)可以參考的規(guī)律,缺少更多成功的案例,缺少臨床獲批的候選化合物。

       如果說針對分子膠,我們還需要什么?毫無疑問,需要的很多。

       但這同樣是所有入局者的機(jī)遇所在。

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