光遺傳學(Optogenetics)是一門將光學和遺傳學技術(shù)相結(jié)合的新興學科,其具有遠程無痕、時空特異性、可調(diào)節(jié)性和可逆性等特點。目前被廣泛應用于生物基礎研究,如控調(diào)控基因組轉(zhuǎn)錄活性、重組信號通路、控制核酸酶的活性,此外也廣泛應用于生命醫(yī)學領(lǐng)域,如糖尿病治療、腫瘤治療等。
其中紅光因具有較高的生物相容性和組織穿透性備受關(guān)注。2017年,華東師范大學生命科學學院葉海峰團隊在 Science Translational Medicine 期刊發(fā)表封面論文,構(gòu)建了一種利用遠紅光來調(diào)控基因表達的工具,并將合成生物學和電子工程學相結(jié)合,首次實現(xiàn)了通過智能手機遠程調(diào)控移植體內(nèi)的光敏細胞表達釋放胰島素降血糖【1】;2021年,該團隊在 Nature Biotechnology 期刊發(fā)表論文,開發(fā)了REDMAP系統(tǒng),該系統(tǒng)具有高轉(zhuǎn)錄激活效率和快速激活/失活動力學的特點【2】。
然而現(xiàn)有的紅光調(diào)控工具在臨床應用中仍然具有很大的局限性,比如光控模塊大,響應光的速度慢,需要外源注射色素分子等問題。
2024年11月27日,華東師范大學生命學院、上海市調(diào)控生物學重點實驗室、醫(yī)學合成生物學研究中心葉海峰團隊在 Nature Communications 期刊發(fā)表了題為:A sensitive red/far-red photoswitch for controllable gene therapy in mouse models of metabolic diseases 的研究論文,
該研究開發(fā)了一種模塊小、無需外源添加色素且靈敏度高的新型光遺傳學工具——REDLIP系統(tǒng)。
新一代光遺傳學工具REDLIP系統(tǒng)設計原理及不同應用場景
DrBphP是一種來自來源于耐輻射球菌(Deinococcus radiodurans)的光敏蛋白,它由一個核心N端PCM結(jié)構(gòu)域和一個C端組氨酸激酶結(jié)構(gòu)域組成。DrBphP PCM與色素(biliverdin IXα, BV)共價結(jié)合后在紅光(660 nm,Pr狀態(tài))和紅外光(780 nm;Prf狀態(tài))之間切換時可以發(fā)生可逆的構(gòu)象變化,并能夠與納米抗體LDB3相互結(jié)合、解離。相較于來源于細菌光敏蛋白,真菌(FphA)和植物(PhyA)的光敏蛋白在N端多了一段NTE序列,有研究表明,NTE結(jié)構(gòu)能夠維持光敏蛋白在660 nm光照后的構(gòu)象(Pfr狀態(tài))狀態(tài),減緩其暗回復。于是,研究團隊將來源于FphA和PhyA的NTE結(jié)構(gòu)分別和DrBphP-PCM進行雜交融合,生成了嵌合光敏蛋白FnBphP和PnBphP。
隨后分別將GAL4的DNA結(jié)合域融合在BphP的N端構(gòu)建出可響應紅光/遠紅光的模塊(Gal4-BphP),將LDB3與轉(zhuǎn)錄激活因子(p65-HSF1)融合形成一個光依賴的轉(zhuǎn)錄激活因子(LDB3-p65-HSF1),當給予紅光(660 nm)光照時,LDB3-p65-HSF1與Gal4-BphP二聚,進入細胞核后識別報告質(zhì)粒上的5×UAS區(qū),在PTATA附近吸引RNA聚合酶,啟動報告基因SEAP表達;換成遠紅光(780 nm)時,LDB3-p65-HSF1與Gal4-BphP分開,停止表達報告蛋白。
研究團隊對不同模塊進行優(yōu)化和測試,發(fā)現(xiàn)Fn-REDLIP系統(tǒng)具有較高的激活能力,Pn-REDLIP系統(tǒng)具有較底的本底泄露 (圖三)。緊接著研究人員對REDLIP系統(tǒng)進行動力學表征。研究結(jié)果顯示,REDLIP系統(tǒng)具有良好的光譜特異性,光照強度、光照時間、以及高度的可逆性和時空特異性。該系統(tǒng)具有超高的靈敏度,只需要10秒鐘的紅光照射,即可實現(xiàn)100倍左右的基因誘導表達效果。
REDLIP光照不同時間的動力學
將REDLIP與CRISPR/dCas9結(jié)合,研究團隊構(gòu)建了一套紅光調(diào)控的基因組轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)(REDLIPcas)。在哺乳動物細胞和小鼠肝臟中實現(xiàn)了光照對內(nèi)源基因轉(zhuǎn)錄的高效調(diào)控,且基因轉(zhuǎn)錄具有良好的光照時間依賴性。
作為概念驗證,研究團隊利用AAV病毒遞送REDLIP系統(tǒng)到代謝疾病小鼠的肌肉、肝臟組織,成功實現(xiàn)了光控胰島素、減肥治療蛋白TSLP的表達,從而有效降低了1型糖尿病模型小鼠的血糖水平和減輕了肥胖模型小鼠的體重。
最后,研究團隊將光遺傳學和電子工程學相結(jié)合,設計了一款能夠通過智能手機ECNU-TeleMed App控制的紅光LED貼片,LED貼片可以很好地解決自然光干擾系統(tǒng)泄露表達的問題,實驗證明,每3天只需要光照半個小時即可實現(xiàn)顯著體重下降,達到光照減肥的效果。
智能手機控制 LED 貼片用于減肥激素的可控釋放
總的來說,REDLIP是一套無需外源添加色素、靈敏性高(< 10s)、誘導效率高(> 100倍)且具有生物兼容性好和組織穿透力強的新型光遺傳學工具,這種光控基因治療策略在需周期性調(diào)控激素類藥物的疾?。ㄈ缣悄虿?、甲狀腺疾病以及與月經(jīng)周期相關(guān)的激素失衡)的精準治療中展現(xiàn)出潛力,有望加速基因治療和細胞治療從基礎研究向生物醫(yī)學轉(zhuǎn)化研究的進展。此外,與電子工程學的結(jié)合,能夠為未來個性化、智能化醫(yī)療領(lǐng)域提供可能。
論文鏈接:
1. https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.aal2298
2. https://www.nature.com/articles/s41587-021-01036-w
3. https://www.nature.com/articles/s41467-024-54781-2
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