TSO 500 ctDNA 2.0版本可提供更快的周轉(zhuǎn)時間、更高的分析靈敏度和更簡化的工作流程,進一步助力精準醫(yī)學的發(fā)展
2023年11月1日,全球基因測序和芯片技術(shù)領(lǐng)導者因美納公司(納斯達克股票代碼:ILMN)宣布推出新一代液體活檢基因組分析產(chǎn)品。全新的TruSight? Oncology 500 ctDNA v2(TSO 500 ctDNA v2)是一項科研檢測產(chǎn)品,可在組織檢測不可行,或需要補充基于組織的測試時,對血液中的循環(huán)腫瘤 DNA (ctDNA)進行無創(chuàng)全景變異分析(CGP)。
該產(chǎn)品的革新之處包括:從樣品到結(jié)果的周轉(zhuǎn)時間更快(不到四天),靈敏度更高,對游離DNA (cfDNA)的起始量要求更低,工作流程也更為精簡高效,并預計將在2024年上半年進一步實現(xiàn)自動化。
因美納腫瘤部總經(jīng)理Kevin Keegan表示:“業(yè)內(nèi)領(lǐng)先的癌癥中心正越來越多地采用基于液體活檢的全景變異分析,我們推出TSO 500 ctDNA v2檢測產(chǎn)品的初衷,是希望支持客戶更便捷地整合分析結(jié)果,進而深化對癌癥研究的洞察。”
重要革新
總周轉(zhuǎn)時間縮短至四天以內(nèi)。文庫準備工作縮短至一天,升級后的化學技術(shù)只需單次雜交步驟,總周轉(zhuǎn)時間可縮短至四天以內(nèi)。大多數(shù)ctDNA CGP檢測的周轉(zhuǎn)時間為一周或更久,但為了使生物標志物結(jié)果發(fā)揮最大價值,用戶需要盡早從中獲得洞察,以更好地推進精準腫瘤學工作。
檢測分析靈敏度更高,cfDNA起始量更低。該檢測支持的cfDNA起始量低至5至30納克 (ng)。起始量為20 ng時,分析靈敏度超過95%,特異性99.9995%。起始量為10 ng時,對于熱點突變的分析靈敏度超過95%,特異性99.9995%。這一性能的提升得益于化學技術(shù)的創(chuàng)新和DRAGEN提供的高級變異分析。
靈活高效的完整解決方案。該檢測為此前已發(fā)布的樣本至結(jié)果的解決方案提供了更廣泛的途徑,既有手動模式,同時也計劃于2024年推出自動化模式。工作流程的改進減少了文庫制備的實際操作時間,自動化生物信息學功能進一步精簡了操作體驗。該檢測還表現(xiàn)出更高的靈活性,可與NovaSeqTM 6000測序系統(tǒng)兼容(科研模式下的NovaSeqTM 6000Dx,以及預計于2024年推出的NovaSeqTM X),同時提供適應各類機構(gòu)需求的本地和云端生物信息學解決方案。
有九家機構(gòu)正在參與因美納的全球早期客戶計劃,試用TSO 500 ctDNA v2。米蘭大學醫(yī)學院病理學教授兼米蘭國家癌癥研究所病理和實驗醫(yī)學部門負責人Giancarlo Pruneri表示,他們在實驗室中對新版TSO500 ctDNA panel進行的初步測試,“無疑比之前的版本有所改進。”
“值得一提的是,文庫制備流程的優(yōu)化節(jié)省了一個工作日,我們能夠更快地進行分子分析。”他表示,“同時檢測靈敏度更高,支持分析DNA含量較低(20 ng)的樣品,潛在地擴大了液體活檢測試的應用范圍。”
隨著液體活檢CGP的實用性和有效性證據(jù)的不斷累積,如今該技術(shù)已被寫入推薦的腫瘤學專業(yè)指南。值得關(guān)注的是,對于非小細胞肺癌,液體活檢檢測在組織檢測結(jié)果無法獲得或只能延遲獲得時,展示了其應用價值。這一趨勢預計將延伸至其他惡性實體瘤,進一步驗證了我們在組織分析之前就對血液中的cfDNA進行廣泛腫瘤分析的這一設想。
“另一方面,傳統(tǒng)的組織分析常常受限于組織的可用性,通常涉及昂貴的侵入性活檢程序。”Pruneri表示,“在這種情況下,因美納的全新panel應運而生,旨在解決對組織可用性的依賴問題。”
TSO 500 ctDNA v2配套的自動化試劑盒以及檢測方法預計將于2024年上半年推出,將助力實驗室根據(jù)這項技術(shù)不斷增長的需求進行相應擴展。
關(guān)于TruSight Oncology 500 ctDNA v2
TSO 500 ctDNA v2是一項僅供科研使用的綜合性泛癌種檢測產(chǎn)品,能夠識別血漿中523種已知和新出現(xiàn)的腫瘤生物標志物。TSO 500 ctDNA v2利用液體活檢樣本中的cfDNA來識別對癌癥發(fā)生和進展至關(guān)重要的關(guān)鍵變異,如小 DNA 變異(SV)、拷貝數(shù)變異(CNV)、短和長插入及缺失 (indel),以及免疫腫瘤學基因特征,如腫瘤突變負荷(bTMB)和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(bMSI)。這種液體活檢全景變異分析測定的內(nèi)容及其設計類似于基于組織的TSO 500檢測,可提供一系列解決方案。強大的DRAGEN生物信息學支持,可提高TSO 500 ctDNA v2解決方案的性能和靈活性。如需了解有關(guān)TSO 500 ctDNA v2的更多信息,請點擊此處。
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