細(xì)胞周期修復(fù),是腫瘤細(xì)胞持續(xù)存活的關(guān)鍵步驟,打破這種平衡,是殺死腫瘤細(xì)胞的重要手段。CDKs蛋白家族抑制劑的治療效果,已于近5年獲得了足夠的臨床證實(shí),CDK4/6更是逐漸成為腫瘤領(lǐng)域的經(jīng)典靶標(biāo),那么,細(xì)胞周期過(guò)程中的另一關(guān)鍵因子CDK2,當(dāng)前開發(fā)狀態(tài)如何?賽道是否擁堵?研發(fā)方是否值得跟進(jìn)?請(qǐng)看本稿件。
01 CDKs于腫瘤環(huán)境中的作用特點(diǎn)
惡性腫瘤通常具有以下特征:細(xì)胞凋亡程序失活、新生血管的形成、免疫監(jiān)視逃避、非生理性生長(zhǎng)信號(hào)/抑制信號(hào)的放大、異常的黏附功能、細(xì)胞永生化等。
其中,靶向調(diào)控腫瘤細(xì)胞周期以改變腫瘤細(xì)胞的凋亡狀態(tài),臨床已被證實(shí)有效,具體代表性品種即為CDK家族抑制劑。
CDK家族靶點(diǎn),主要分為兩大類,一是參與細(xì)胞周期調(diào)控,相關(guān)有絲分裂,亞型代表有CDK1、2、4、6;另一類主要參與轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié),調(diào)節(jié)RNA聚合酶II的磷酸化修飾,亞型代表有CDK7、8、9、11;具體見下圖。
主要CDK及其功能示意圖(參考:藥學(xué)進(jìn)展/2015)
02 CDK2靶點(diǎn)機(jī)制
在有絲分裂信號(hào)的刺激下,細(xì)胞由G0期進(jìn)入到有絲分裂Gl期,細(xì)胞內(nèi)部活動(dòng)逐漸上調(diào)。CDK4/6與cyclinD結(jié)合,促使視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤蛋白(Rb)磷酸化,部分轉(zhuǎn)錄延展因子E2F的活性得以釋放,用于合成大量的RNA與蛋白質(zhì),為染色體復(fù)制做準(zhǔn)備。
G1后期,CDK2與cyclinE結(jié)合形成蛋白酶體復(fù)合物CDK2-cyclinE并活化,促使Rb進(jìn)一步磷酸化,誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子E2F的持續(xù)表達(dá),從而調(diào)控細(xì)胞順利通過(guò)G1期。進(jìn)入S期后,CDK2與cyclinA結(jié)合形成復(fù)合物CDK2-cyclinA參與到細(xì)胞周期S期的進(jìn)程,完成DNA的復(fù)制。
隨后,cyclinA/B與CDK1形成CDK1-cyclinA/B復(fù)合物,驅(qū)動(dòng)細(xì)胞周期進(jìn)入G2/M期,合成RNA與蛋白質(zhì)為紡錘絲的形成做準(zhǔn)備。最終,細(xì)胞有序地經(jīng)過(guò)G1-S-G2-M所有細(xì)胞周期完成細(xì)胞的有絲分裂。
CDK2調(diào)節(jié)有絲分裂過(guò)程(中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào)/2021)
結(jié)構(gòu)上,CDK2蛋白高度保守,由298個(gè)氨基酸組成,蛋白折疊呈雙葉狀,ATP結(jié)合區(qū)就位于這兩個(gè)“葉狀”之間的深裂,決定著ATP或者蛋白結(jié)合底物與CDK2的特異性結(jié)合,在細(xì)胞調(diào)控機(jī)制中起關(guān)鍵作用。
圖2.1 CDK2-3D結(jié)構(gòu)(PDB:1HCL)
03 CDK2臨床在研藥物
1990s起,CDK2抑制劑的開發(fā)即已經(jīng)有品種進(jìn)入到臨床階段,但幾乎都以多靶點(diǎn)抑制劑為主。
正構(gòu)方向,CDK2中的Ilel0、Vall8、Ala31、Lys33、Phe80、Glu81、Phe8、Leu83、His84、Gln85、Asp86、Lys89、Glnl31、Leul34、Alal44和Aspl45等位點(diǎn),在結(jié)合ATP的過(guò)程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。
但由于ATP結(jié)合口袋在CDK蛋白家族中的高度保守,使得針對(duì)ATP結(jié)合口袋開發(fā)選擇性CDK2抑制劑較為困難,故非ATP結(jié)合的別構(gòu)抑制劑也在開發(fā)當(dāng)中,且已發(fā)現(xiàn)2個(gè)抑制劑新結(jié)合口袋:
1)由Leu55、Lys56、Phe80、Asp145、Phe146和Lys33組成,位于ATP結(jié)合位點(diǎn)和C-端螺旋的中間;
2)由Leu124、Phe152、Val154-156、Glu172、Gly176、Thr182、Val184、Val227-230、Ser232-234和Asp270-Asn272組成。
Dinaciclib(III期)
開發(fā)公司為默沙東,為CDK1/2/5/9抑制劑,目前處在臨床III期用于治療難治愈的慢性淋巴細(xì)胞白血病。2011年,F(xiàn)DA授予Dinaciclib治療CLL孤兒藥資格。該品種對(duì)CDK2、CDK5、CDK1和CDK9均有抑制活性,IC50分別為1nM、1nM、3nM和4nM;臨床研究結(jié)果表明,Dinaciclib與利妥昔單抗聯(lián)合用藥治療復(fù)發(fā)性慢性淋巴細(xì)胞性白血病時(shí),患者的耐受性良好。
Seliciclib(II期)
開發(fā)公司為Cyclacel Pharmaceuticals,是CYC-200系列口服小分子細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶(CDK1/2/5/7)抑制劑的先導(dǎo)化合物,已在超過(guò)100種細(xì)胞系中進(jìn)行了抗增殖活性的測(cè)定,目前處于臨床II期,用于治療B淋巴細(xì)胞白血病,與吉西他濱/順鉑聯(lián)合使用作為一線用藥治療非小細(xì)胞肺癌。另,公司還在研究該藥物用于潛在治療與SARS-CoV-2感染(COVID-19)相關(guān)的炎癥。
PF-07104091(I/II期)
開發(fā)公司為輝瑞,屬CDK2選擇性抑制劑,口服用于多種癌癥的治療,包括乳腺癌、小細(xì)胞肺癌、非小細(xì)胞肺癌、卵巢癌等。2020年9月,啟動(dòng)了晚期SCLC、晚期上皮性卵巢/輸卵管/原發(fā)性腹膜癌、晚期乳腺癌和晚期NSCLC的I/II期試驗(yàn);2020年10月,公司將該藥物列為轉(zhuǎn)移性乳腺癌的I期試驗(yàn)。2021年4月,臨床前數(shù)據(jù)在第112屆AACR年會(huì)上公布:OVCAR3模型中,PF-07104091(25、75和175mg/kg,po,bid)表現(xiàn)出劑量依賴性腫瘤減少,最 大作用為86%;CCNE1(high)卵巢模型(OV5392)中,PF-07104091(75和150mg/kg,po,bid)顯示出類似于在OVCAR-3中觀察到的腫瘤生長(zhǎng)抑制;NCI-H526細(xì)胞(Rb(mut))SCLC模型中,PF-07104091(25、75、175或150mg/kg,po,bid)表現(xiàn)出單一藥物活性;ER+HER2-乳腺癌細(xì)胞系中,PF-07104091和palbociclib表現(xiàn)出協(xié)同的細(xì)胞生長(zhǎng)抑制作用;T47D模型中,PF-07104091(150mg/kg,po,bid)+palbociclib(10mg/kg,po,bid)表現(xiàn)出聯(lián)用效果。
Ebvaciclib(I/II期)
開發(fā)公司為輝瑞,為一種CDK2/4/6抑制劑;2018年11月,在愛爾蘭都柏林舉行的第30屆AACR年會(huì)上,首次公布了Ebvaciclib的體外和體內(nèi)數(shù)據(jù);Ebvaciclib對(duì)CDK2、4、5和6的結(jié)合親和力較高,較脫靶的CDK1和CDK9高40倍。2018年3月,在接受過(guò)CDK4/6抑制劑治療和HR陽(yáng)性HER2陰性乳腺癌、轉(zhuǎn)移性三陰性乳腺癌或晚期鉑耐藥性上皮性卵巢癌/輸卵管癌的難治/復(fù)發(fā)患者中啟動(dòng)了I/II期試驗(yàn),預(yù)計(jì)在2021年獲得試驗(yàn)數(shù)據(jù)。
Fadraciclib(I期)
開發(fā)公司為Cyclacel Pharmaceuticals,一種CDK2/9抑制劑,靜脈注射用于治療晚期癌癥,包括慢性淋巴細(xì)胞白血病、急性髓系白血病和骨髓增生異常綜合征。2018年4月,臨床前數(shù)據(jù)在芝加哥舉行的第109屆AACR年會(huì)上公布;2018年11月,啟動(dòng)復(fù)發(fā)或難治性CLL的臨床I期試驗(yàn);2019年7月,啟動(dòng)復(fù)發(fā)或難治性AML和MDS的臨床I期試驗(yàn)。
NUV-422(I/II期)
開發(fā)公司為Nuvation Bio,為CDK2/4/6抑制劑,臨床開發(fā)用于膠質(zhì)瘤的治療。2020年11月,啟動(dòng)一項(xiàng)針對(duì)復(fù)發(fā)或難治性高級(jí)別膠質(zhì)瘤成人患者的I/II期試驗(yàn);2021年2月,該公司計(jì)劃在啟動(dòng)腦轉(zhuǎn)移I期試驗(yàn),之后啟動(dòng)腦轉(zhuǎn)移、雌激素受體陽(yáng)性轉(zhuǎn)移性乳腺癌的I期試驗(yàn),再之后啟動(dòng)轉(zhuǎn)移性去勢(shì)耐藥前列腺癌的I期試驗(yàn)。
圖3.2 CDK2抑制劑部分化學(xué)結(jié)構(gòu)
04 國(guó)內(nèi)研發(fā)跟進(jìn)狀態(tài)
通過(guò)專利查詢,國(guó)內(nèi)對(duì)于CDK2抑制劑的開發(fā):國(guó)外申請(qǐng)人主要有艾文蒂斯藥品公司、霍夫曼-拉羅奇有限公司,等;國(guó)內(nèi)申請(qǐng)人主要有中國(guó)藥科大學(xué)、四川大學(xué)、濱州醫(yī)學(xué)院、常州大學(xué)、江南大學(xué),等。由此不難看出,目前國(guó)內(nèi)對(duì)于該靶點(diǎn)的品種,尚無(wú)大量藥企進(jìn)行跟進(jìn),賽道通暢。
參考文獻(xiàn):
1.Targeting CDK2 in cancer: challenges and opportunities for therapy. Drug Discovery Today. doi.org/10.1016/j.drudis.2019.12.001.
2.To control or to be controlled? Dual roles of CDK2 in DNA damage and DNA damage response. DNA Repair. doi.org/10.1016/j.dnarep.2019.102702.
3.細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶2的功能及其抑制劑的研究. 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào)/2021.
4.CDK 抑制劑在抗腫瘤領(lǐng)域的研發(fā)進(jìn)展.藥學(xué)進(jìn)展/2015.
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