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CPHI制藥在線 資訊 Delta變異新冠病毒洶洶來襲,核酸檢測能否跟上它的腳步?

Delta變異新冠病毒洶洶來襲,核酸檢測能否跟上它的腳步?

作者:原祎鳴  來源:界面新聞
  2021-06-22
雖然檢測試劑的開發(fā)并不困難,但如何在實(shí)踐中保障大規(guī)模的檢測結(jié)果對各省市來說仍然是個(gè)考驗(yàn)。

記者 |原祎鳴

編輯 |謝欣

       變異的新冠病毒Delta毒株,正考驗(yàn)著中國對新冠病毒的防御能力。

       6月19日,深圳市通報(bào)上一日兩名新增本土確診病例,所感染的病毒均為變異新冠病毒Delta毒株。而5月21日報(bào)告第一例本土感染的廣州疫情,也是由該變異新冠病毒導(dǎo)致。

       為應(yīng)對Delta變異毒株,廣東省多地已開展多輪大規(guī)模核酸篩查。深圳市副市長陶永欣6月19日在深圳市疫情防控新聞發(fā)布會(huì)上表示,深圳市涉及的重點(diǎn)區(qū)和重點(diǎn)行業(yè)已經(jīng)開展多輪大規(guī)模核酸篩查。6月21日,廣東省東莞市、寮步鎮(zhèn)等地也啟動(dòng)了全市核酸檢測。

       這也被認(rèn)為是中國與Delta變異毒株的第一次正面遭遇戰(zhàn),在有著超強(qiáng)傳播力的Delta變異毒株面前,國內(nèi)所依靠的核酸檢測手段將如何應(yīng)對?

       超強(qiáng)傳播力的Delta

       Delta變異毒株是由新冠病毒B.1.617.2變異株進(jìn)一步變異而成的,最早發(fā)現(xiàn)于印度。今年5月,世界衛(wèi)生組織(WHO)給這種變異病毒起名為Delta(德爾塔)變異株。

       與其他毒株相比,Delta變異毒株最讓人警惕之處在于其超強(qiáng)的傳播力。中國疾控中心研究員馮子健6月11日在國務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機(jī)制新聞發(fā)布會(huì)上表示,Delta變異毒株的傳播能力是目前已經(jīng)確定的幾個(gè)新冠病毒值得關(guān)注的變異株里傳播能力最強(qiáng)的,比過去的老的毒株傳播能力提高了100%,也比英國首先發(fā)現(xiàn)的變異毒株的傳播能力提高了40%多。

       超強(qiáng)的傳播力也讓Delta變異毒株迅速在全球蔓延。

       英國英格蘭公共衛(wèi)生署當(dāng)?shù)貢r(shí)間6月18日發(fā)布報(bào)告表示,該國自6月11日以來,感染“德爾塔(Delta)毒株”的病例增加了33630例,根據(jù)最新測序和基因分型數(shù)據(jù)顯示,過去一周,英國目前有99%的確診病例感染了Delta變異毒株。俄羅斯莫斯科市長索比亞寧表示,莫斯科89.3%的新冠肺炎患者體內(nèi)都發(fā)現(xiàn)了Delta變異毒株。

       WHO首席科學(xué)家斯瓦米納坦6月18日則表示,最初在印度發(fā)現(xiàn)的新冠變種病毒Delta正成為全球主要流行的變種病毒株。根據(jù)世衛(wèi)官員16日發(fā)布的數(shù)據(jù),Delta變種已傳播至超過80個(gè)國家。

       萬孚生物方面對界面新聞介紹稱,目前全球范圍內(nèi)發(fā)現(xiàn)的變異株有多種,但是引起科學(xué)家們注意的主要是英國株(Alpha)、南非株(Beta)、巴西株(Gamma)、印度株(Delta)等變異株,上述變異株在傳染性以及免疫逃逸方面都有所增強(qiáng),對疫情防控及**接種工作都帶來了新的挑戰(zhàn)。

       而除了急需研究各種新冠**對變異毒株的保護(hù)效力,作為疫情防控的另一款有力武器,現(xiàn)有的核酸檢測手段又能否準(zhǔn)確的檢測出Delta變異毒株?

       核酸檢測迎戰(zhàn)Delta變異毒株

       據(jù)華大基因向界面新聞介紹,在實(shí)踐中,核酸檢測準(zhǔn)確性會(huì)受到病毒特征、檢測產(chǎn)品或技術(shù)本身、采樣過程、樣本儲(chǔ)存、運(yùn)輸及檢測能力等因素的影響。

       而核酸檢測是對新冠病毒特征RNA序列進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增反應(yīng),體外定性檢測受檢者樣本中的新冠病毒核酸。由于核酸是病毒的遺傳物質(zhì),理論上對新冠病毒的特征序列進(jìn)行核酸檢測就可以確定是否為新冠病毒感染。而不同生產(chǎn)商在設(shè)計(jì)核酸檢測試劑盒時(shí)使用的引物探針并不相同,對新冠病毒突變株的檢測能力不能一概而論,需要具體分析。

       賓夕法尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理及實(shí)驗(yàn)醫(yī)藥系副教授張洪濤用“拉鏈”來比喻新冠病毒核酸檢測。其介紹到,DNA有兩條互補(bǔ)的拉鏈,檢測病毒的PCR反應(yīng),也是按照兩條鏈的互補(bǔ)性進(jìn)行的。

       “PCR就是把互補(bǔ)的兩條拉鏈從其尾巴的位置拉起來。變異新冠病毒可以理解為拉鏈上的某個(gè)齒壞了,但如果壞在中間,也許還拉得過去,但如果拉鏈的尾巴位置壞了,PCR就拉不過去了。”張洪濤告訴界面新聞?dòng)浾摺?/p>

       張洪濤表示,一般檢測試劑盒里也會(huì)同時(shí)有兩條、甚至三條拉鏈,雖然病毒突變頻繁發(fā)生,但是幾條拉鏈同時(shí)都壞掉的概率非常小。因此如果是“中間的齒壞了”原有的核酸檢測試劑一般還能檢測出病毒,但可能會(huì)只有在變異新冠病毒載量更高的時(shí)候才能測得出,如果疫情變嚴(yán)重了,就要考慮更新檢測試劑,以方便在感染早期就及時(shí)發(fā)現(xiàn)感染者。因此他認(rèn)為,可以先用原有的新冠檢測試劑進(jìn)行大規(guī)模測量,再針對性地對陽性患者來使用特定試劑以精確篩查。

       不過,據(jù)萬孚生物介紹,國內(nèi)此前已上市的大多數(shù)新冠核酸檢測試劑不能夠區(qū)分新冠普通株以及變異株,這給相關(guān)流調(diào)工作帶來一定的困難。這也就要求新冠核酸檢測廠家要具備快速響應(yīng)能力以及快速研發(fā)能力,以便應(yīng)對未來新發(fā)現(xiàn)的變異株的檢測,新開發(fā)的試劑如果需要快速上市,盡早的投入到疫情防控中,還需要相關(guān)政府部門的政策支持。

       在這樣的情況下,就要先對新冠病毒進(jìn)行基因測序,知道拉鏈壞在哪,才可以針對拉鏈的變異進(jìn)行的調(diào)整。“測序完成之后,制定出相應(yīng)的檢測試劑是十分容易的。”張洪濤告訴界面新聞?dòng)浾摺?/p>

       目前,英國和國內(nèi)都已經(jīng)研發(fā)出了針對Delta變異毒株的新冠檢測試劑。6月9日,廣州市科學(xué)技術(shù)局黨組成員、副局長孫翔在廣州市政府新聞發(fā)布會(huì)上透露,達(dá)安基因、萬孚生物都開發(fā)出了新的核酸檢測試劑。

       復(fù)星醫(yī)藥旗下復(fù)星診斷對界面新聞介紹,針對變異毒株的“檢測”和“鑒別”概念不一樣,“檢測”是檢測新冠病毒陽性與否,而“鑒別”具體是哪種變異毒株則需要采用另外的試劑或方法。目前變異毒株種類鑒別國內(nèi)多用測序法,也可以采用專門的變異株鑒別試劑。

       萬孚生物對界面新聞表示,針對突變毒株的新檢測試劑不需要進(jìn)行太大的改動(dòng),只需要開發(fā)針對的變異株的特異性的引物及探針,對反應(yīng)體系進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整,并進(jìn)行臨床驗(yàn)證即可。

       不過復(fù)星診斷也表示,其自主研發(fā)的新冠核酸檢測試劑同時(shí)檢測ORF1ab、N和E基因等3靶標(biāo)序列,各靶標(biāo)結(jié)果相互驗(yàn)證,對低病毒載量樣本及發(fā)生點(diǎn)突變的病毒株,不易發(fā)生漏檢,根據(jù)其對引物探針與國際上最新變異株(包含但不限于B.1.1.7、B.1.351、P.1、B.1.617變異株)攜帶的突變位點(diǎn)的核對,結(jié)果證實(shí)不會(huì)出現(xiàn)脫靶和漏檢情況,可保證該試劑針對變異株檢測和常規(guī)新冠病毒檢測的準(zhǔn)確性和靈敏性一致。

       而在實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)流程上,金域醫(yī)學(xué)和多家檢測企業(yè)都告訴界面新聞?dòng)浾?,變異新冠病毒的?shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)流程上同此前的新冠病毒毒株一致,無需調(diào)整。

       雖然檢測試劑的開發(fā)并不困難,但如何在實(shí)踐中保障大規(guī)模的檢測結(jié)果對各個(gè)省市來說仍然是個(gè)考驗(yàn)。“既要同時(shí)對大規(guī)模人群進(jìn)行檢測,又要防止人群互相感染,還要防止新冠**污染核酸檢測的結(jié)果。”張洪濤提到了落實(shí)大規(guī)模核酸檢測的難處。

       華大基因也向界面新聞表示,核酸檢測的采樣過程、樣本的儲(chǔ)存、運(yùn)輸?shù)陌踩远际谴笠?guī)模進(jìn)行核酸檢測所需面臨的挑戰(zhàn)。

       此外,新研發(fā)的針對Delta變異毒株的試劑盒的產(chǎn)量提升也需要時(shí)間,而在于Delta變異毒株的交手中,依然需要足量的新試劑來保障大規(guī)模檢測的準(zhǔn)確性,這在短期內(nèi)也可能會(huì)成為一個(gè)挑戰(zhàn)。

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