目前使用的基因編輯有三種主要類型:鋅指核酸酶(ZFN)、轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)核酸酶(TALEN)、定期聚集的短回文重復(fù)序列(CRISPR)。所有這三種類型都針對(duì)特定的DNA序列,從基因中切除這些序列。ZFN是最古老的基因編輯方法,可追溯到20世紀(jì)90年代。這是基因編輯的唯一方法,直到2009年發(fā)現(xiàn)TALEN方法,提供更具體的DNA序列靶向。
基因編輯技術(shù)發(fā)展的元年可以說(shuō)是在2012年,因?yàn)檫@一年發(fā)現(xiàn)了CRISPR。CRISPR被認(rèn)為是最準(zhǔn)確、最有效、最快速和最簡(jiǎn)單的基因編輯工具,它使科學(xué)家能夠比以往更精確地編輯或修改幾乎任何生物體的基因組。過(guò)去幾年以來(lái),“CRISPR”一詞不斷在各種科學(xué)和非科學(xué)界引起轟動(dòng)。
近日,全球生物技術(shù)最權(quán)威的雜志《GEN》發(fā)布了“2019年全球10大基因編輯公司”,該榜單包括了基因編輯領(lǐng)域的5家上市公司和5家非上市公司。其中,上市公司按照2018年的收入進(jìn)行排名,包括來(lái)自產(chǎn)品或銷售服務(wù)以及合作和研發(fā)活動(dòng),非上市公司根據(jù)所披露的籌集到的總資本進(jìn)行排名。
相較于2018年的榜單,我們依舊可以在 2019年榜單中看到與CRISPR“三大先驅(qū)”張鋒、Jennifer Doudna、Emmanuelle Charpentier相關(guān)的公司身影。有所變化的是,由Emmanuelle Charpentier聯(lián)合創(chuàng)立的CRISPR Therapeutics因收入表現(xiàn)跌出TOP5上市公司榜單,而由CRISPR Therapeutics與拜耳成立的合資企業(yè)Casebia則登上了TOP5非上市公司榜單。
以下是2019年全球十大基因編輯公司榜單:
TOP5上市公司
#1.Sangamo Therapeutics
成立時(shí)間:1995年
2018年收入:8445.2萬(wàn)美元
Sangamo Therapeutics是一家通過(guò)基因編輯技術(shù)開(kāi)展臨床階段藥物研發(fā)的公司,專注于鋅指蛋白技術(shù)(ZFP)的研究開(kāi)發(fā)和商業(yè)化。該公司是全球應(yīng)用鋅指蛋白技術(shù)最廣泛的公司,開(kāi)展了一系列臨床階段的人類疾病治療?;诨蛑委煹亩嗥脚_(tái)方法,包括基因治療、基因組編輯、細(xì)胞療法、基因調(diào)控等,Sangamo在血友病、血紅蛋白病、中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病、艾滋病等領(lǐng)域布局產(chǎn)品管線。
Sangamo2018年的收入比2017年的3656.7萬(wàn)美元增加了一倍多,這歸功于與Kite(吉利德公司)和輝瑞公司的合作。最近,Sangamo的研究人員專注于使用鋅指核酸酶(ZFNs)增強(qiáng)基因組編輯。7月29日,Sangamo團(tuán)隊(duì)在《Nature Biotechnology》雜志上發(fā)表文章稱,設(shè)計(jì)ZFN結(jié)構(gòu)內(nèi)的兩個(gè)關(guān)鍵功能區(qū),即調(diào)節(jié)識(shí)別DNA的鋅指陣列的結(jié)合親和力,并減慢Fok1切割結(jié)構(gòu)域的催化速率??梢越M合這兩種互補(bǔ)的方法,以實(shí)現(xiàn)接近100%的目標(biāo)修飾而沒(méi)有可檢測(cè)的脫靶。今年3月,Sangamo團(tuán)隊(duì)在《Nature Communications》雜志上報(bào)道稱,通過(guò)一系列蛋白質(zhì)改造工作,開(kāi)發(fā)出新的ZFN結(jié)構(gòu)。這些改造包括顛倒DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域和核酸酶結(jié)構(gòu)域的順序,以及運(yùn)用新的接頭(linker)跳過(guò)相鄰鋅指之間的堿基。通過(guò)這種結(jié)構(gòu)多樣化的策略,他們?cè)噲D大幅度提高ZFN的靶向精確度。
#2. Horizon Discovery Group
成立時(shí)間:2005年
2018年收入:5870萬(wàn)英鎊(7118.6萬(wàn)美元)
Horizon Discovery總部位于英國(guó)劍橋,其技術(shù)核心是基因編輯技術(shù),至今已經(jīng)有超過(guò)十年的基因編輯經(jīng)驗(yàn),從早期的rAAV技術(shù)到ZFN以及近幾年火熱的CRISPR技術(shù),Horizon都有專利授權(quán)。
Horizon Discovery公司2018年收入比2017年增長(zhǎng)了68%。這一增長(zhǎng)也歸功于其最近的合作:Celyad正在開(kāi)發(fā)第一個(gè)非基因編輯的同種異體CAR-T臨床項(xiàng)目,使用Horizon Discovery的SMARTvector?短發(fā)夾RNA(shRNA)技術(shù)平臺(tái)。2018年,AstraZeneca采用了Horizon Discovery的Edit-R crRNA文庫(kù)作為其功能基因組學(xué)發(fā)現(xiàn)平臺(tái)的一部分。而B(niǎo)iocartis的Idylla?微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)分析得到了Horizon Discovery開(kāi)發(fā)的細(xì)胞系衍生參考標(biāo)準(zhǔn)的支持。
#3. Editas Medicine
成立時(shí)間:2013年
2018年收入:3197.7萬(wàn)美元
Editas Medicine總部位于美國(guó)馬薩諸塞州,創(chuàng)始人之一是CRISPR領(lǐng)域的“大神級(jí)人物”張鋒。該公司正在開(kāi)發(fā)基于CRISPR/Cas9技術(shù)專利的基因組編輯平臺(tái),致力于通過(guò)改變患者的致病基因來(lái)治療相應(yīng)的疾病。目前,該公司已建成一個(gè)多樣化的管線,包括針對(duì)眼睛疾病、肌肉疾病、血液疾病、肺病、肝病和癌癥的產(chǎn)品。
由于與Beam Therapeutics、Juno Therapeutics(去年被Celgene收購(gòu))、特別是Allergan的合作,Editas2018年在合作和其他研發(fā)的收入從2017年的1370萬(wàn)美元翻了一倍多。Editas和Allergan于4月份宣布在2019年下半年開(kāi)始對(duì)患者進(jìn)行體內(nèi)CRISPR的首次臨床試驗(yàn)。這項(xiàng)工作也是Cynthia Collins的首要任務(wù),她于今年3月份被任命為臨時(shí)首席執(zhí)行官,8月6日被任命為常任總裁兼首席執(zhí)行官。
#4. Intellia Therapeutics
成立時(shí)間:2014年
2018年收入:3034.4萬(wàn)美元
Intellia Therapeutics總部位于美國(guó)馬薩諸塞州,專注于利用生物工具CRISPR/Cas9系統(tǒng)開(kāi)發(fā)專有的、有潛力的治愈療法。作為Editas Medicine最強(qiáng)大的競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手,Intellia獲得了CRISPR先驅(qū)之一的女科學(xué)家Jennifer Doudna授權(quán)的相關(guān)知識(shí)產(chǎn)權(quán)。
Intellia與諾華和Regeneron Pharmaceuticals的合作,使其公司收入增長(zhǎng)從2017年的2611.7萬(wàn)美元增加了16.5%。同時(shí),Intellia和Regeneron(2016年啟動(dòng)的一項(xiàng)合作)在Intellia-led NTLA-2001項(xiàng)目上進(jìn)行合作。2018年12月,Intellia擴(kuò)大了與諾華公司的細(xì)胞療法合作,包括眼部干細(xì)胞 (諾華公司為此向Intellia支付了1000萬(wàn)美元),并獲得了對(duì)諾華公司LNP庫(kù)的擴(kuò)大使用權(quán)。
#5. Precision BioSciences
成立時(shí)間:2006年
2018年收入:1088.3萬(wàn)美元
Precision BioSciences總部位于美國(guó)北卡羅來(lái)納州,致力于開(kāi)發(fā)新一代基因組編輯技術(shù)平臺(tái)ARCUS在癌癥免疫療法、遺傳疾病和食品領(lǐng)域的應(yīng)用。在癌癥免疫療法領(lǐng)域,該公司的目標(biāo)是通過(guò)基因組編輯技術(shù),在CAR-T或TCR細(xì)胞療法中切除導(dǎo)致患者免疫系統(tǒng)攻擊供體T細(xì)胞和導(dǎo)致供體T細(xì)胞攻擊患者健康組織的基因,讓癌癥患者可以使用健康供體生成的T細(xì)胞療法,不再局限于依靠患者本身的T細(xì)胞。
Precision BioSciences自今年4月1日完成首次公開(kāi)IPO以來(lái),已開(kāi)始在PBCAR0191的 I / IIa期試驗(yàn)(NCT03666000)中進(jìn)行患者給藥。PBCAR0191是該公司與Servier一起開(kāi)發(fā)的首個(gè)基因編輯的同種異體抗CD19 CAR T-細(xì)胞產(chǎn)品。7月,Precision在北卡羅來(lái)納州達(dá)勒姆建立了高級(jí)治療制造中心(MCAT)。該公司稱這是目前美國(guó)第一家符合cGMP標(biāo)準(zhǔn)的內(nèi)部制造工廠,專門用于基因組編輯的現(xiàn)成CAR-T細(xì)胞療法。在完成調(diào)試、鑒定和驗(yàn)證后,MCAT將在第四季度開(kāi)始cGMP生產(chǎn)。
TOP5非上市公司
#1. Casebia
成立時(shí)間:2016年
募集資金總額:3億美元
Casebia是CRISPR Therapeutics與拜耳成立的一家對(duì)半持股的合資企業(yè),旨在利用基因編輯技術(shù)開(kāi)發(fā)血液疾病和自身免疫、代謝和先天性心臟病的治療方法。
Casebia成立之時(shí),拜耳同意在未來(lái)五年內(nèi)向CRISPR Therapeutics支付至少3億美元的研發(fā)投資,另外還有3500萬(wàn)美元現(xiàn)金用于購(gòu)買CRISPR Therapeutics的少數(shù)股權(quán)。上個(gè)月在2019年國(guó)際血栓形成和止血學(xué)會(huì)大會(huì)上,Casebia首席科學(xué)家Alan Brooks博士報(bào)告了一種基因編輯方法的研究,該方法通過(guò)使用CRISPR-Cas9在小鼠中顯示穩(wěn)定的、可滴定的因子VIII表達(dá),來(lái)管理治療血友病a的因子VIII的產(chǎn)生。
#2.Poseida Therapeutics
成立時(shí)間:2014年
募集資金總額:2.265億美元
Poseida Therapeutics是一家臨床階段的生物制藥公司,旨在將一流的非病毒基因工程技術(shù)轉(zhuǎn)化為能拯救生命的治療手段,從而用于治療各種疑難疾病。公司正在獨(dú)立研發(fā)一種自體和同種異體CAR-T(候選產(chǎn)品,該產(chǎn)品可以治療血液系統(tǒng)惡性腫瘤和實(shí)體瘤以及一些罕見(jiàn)遺傳?。?。
今年4月,Poseida宣布完成1.42億美元C輪融資,由諾華出資7500萬(wàn)美元領(lǐng)投。Poseida表示,利用這筆資金全面推進(jìn)目前進(jìn)行的CAR-T計(jì)劃,包括罕見(jiàn)遺傳病的基因療法。今年5月,Poseida獲得了FDA對(duì)其CAR-T候選藥物的孤兒藥指定,該藥物名為P-BCMA-101,用于復(fù)發(fā)和/或難治性多發(fā)性骨髓瘤(r/rMM)。
#3. Beam Therapeutics
成立時(shí)間:2018年
募集資金總額:2.22億美元
Beam Therapeutics是首個(gè)利用CRISPR單堿基編輯技術(shù)開(kāi)發(fā)全新療法的公司,由張鋒、David Liu以及J. Keith Joung三位CRISPR領(lǐng)域的“大神級(jí)人物”共同創(chuàng)立。公司在成立之初就宣布完成8700萬(wàn)美元的A輪融資。今年3月,公司又宣布完成1.35億美元B輪融資,資金將用于推進(jìn)下一代CRISPR技術(shù)的開(kāi)發(fā),擴(kuò)大在堿基編輯技術(shù)方面的領(lǐng)導(dǎo)地位,并將產(chǎn)品管線推向臨床開(kāi)發(fā)。
5月,Beam和日本生物技術(shù)公司Bio Palette宣布了一項(xiàng)關(guān)于各自基礎(chǔ)編輯知識(shí)產(chǎn)權(quán)(IP)的獨(dú)家交叉許可協(xié)議。同時(shí),Beam還通過(guò)多個(gè)平臺(tái)為哈佛大學(xué)、Broad Institute、MIT和Editas Medicine提供技術(shù)授權(quán)。
#4.Synthego
成立時(shí)間:2012年
募集資金總額:1.58億美元
Synthego總部在加州硅谷,是一家為科學(xué)家和研究人員提供基因工程細(xì)胞的公司。該公司由 Paul Dabrowski 和 Michael Dabrowski 兄弟二人創(chuàng)立,在正式進(jìn)入生物科學(xué)領(lǐng)域之前,他們?cè)吐氂诎B?馬斯克創(chuàng)立的 SpaceX公司。
在登上福布斯2019年估值10億美元?jiǎng)?chuàng)業(yè)公司排行榜前一個(gè)月,Synthego宣布了爆炸性消息——推出了Gene Knockout Kit v2。該試劑盒旨在通過(guò)利用新的生物信息學(xué)驅(qū)動(dòng)的多指導(dǎo)策略來(lái)確保基因敲除,該策略使用多達(dá)三個(gè)針對(duì)同一基因的修飾的sgRNA。Synthego表示,這套設(shè)備將使科學(xué)家在優(yōu)化CRISPR實(shí)驗(yàn)時(shí)避免多次反復(fù)試驗(yàn),從而加快研究速度。2018年10月,Synthego完成了由Founders Fund牽頭的1.1億美元C系列融資,籌集了總資本的三分之二以上。
#5.Inscripta
成立時(shí)間:2015年
募集資金總額:1.345億美元
Inscripta是一家基因編輯技術(shù)公司,總部位于美國(guó)科羅拉多州,致力于創(chuàng)造革命性的基因編輯技術(shù)和工具,為人類的食品、燃料和醫(yī)療等帶來(lái)變革。
在2019年的合成生物學(xué):工程、進(jìn)化與設(shè)計(jì)(SEED)會(huì)議上,Inscripta首次公開(kāi)展示了其基于CRISPR的最新技術(shù),該技術(shù)旨在以前所未有的規(guī)模實(shí)現(xiàn)多路可跟蹤的細(xì)胞編輯。該公司基于前沿的CRISPR基因編輯原理,開(kāi)發(fā)一類CRISPR酶類家族(稱為MADzymes),可為研究人員和商業(yè)合作伙伴專門定制所需的核酸酶,以及全套基因編輯配套工具(軟件、儀器和試劑等),這些工具將大大提高基因編輯的速度和效率。今年4月,Inscripta宣布,在2018年的8550萬(wàn)美元C輪融資的基礎(chǔ)上,又新增了2000萬(wàn)美元融資,使本輪融資總額達(dá)到1.055億美元。
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