領(lǐng)星完成中國第一個評估 CWES 戰(zhàn)略臨床效益的研究,證明CWES有提升腫瘤患者臨床獲益的潛力。
前不久,領(lǐng)星與中國人民解放軍總醫(yī)院的焦順昌教授及其團隊合作撰寫的學術(shù)論文 "Using clinical genomic sequencing to guide personalized cancer therapy in China" 于 SCI 期刊 Personalized Medicine 發(fā)表。
隨著分子靶向治療和免疫治療的發(fā)展,精準醫(yī)療時代已經(jīng)來臨。精準醫(yī)療有時也被稱為“個體化醫(yī)療”,可以根據(jù)患者的基因組、生活習慣、風俗習慣和環(huán)境的不同,為患者量身定制疾病預防、診斷和治療服務,使患者在更有質(zhì)量的生活狀態(tài)下獲得更可觀的臨床獲益。
值得欣慰的是,現(xiàn)下對于腫瘤的認識日新月異,不斷有新的抗腫瘤靶點被開發(fā),各類抗腫瘤新藥及新療法的臨床試驗數(shù)量呈爆炸性的增長。
在這樣的大環(huán)境下,對于有限的腫瘤樣本,使用單基因或小 panel 的檢測或許會錯失許多潛在的有價值的信息。相較之下,全外顯子組測序 (WES) 可以為腫瘤患者的診斷、治療和預后提供更為全面的信息,因為外顯子組雖然在人類基因組中的占比不到2%,但卻包含了約85%的已知致病變異。
在這項研究中,領(lǐng)星對一千多例中國腫瘤患者的樣本進行了臨床全外顯子組測序 (CWES),然后對其中成功檢測的953例中國腫瘤患者的突變特征進行了鑒定,并與 The Cancer Genome Atlas (TCGA)的 WES 數(shù)據(jù)進行了比對。此外,領(lǐng)星還對其中22例在前期治療中失敗的 IV 期腫瘤患者進行了長期隨訪,以評估 CWES 分析對臨床結(jié)果的影響。
主要研究結(jié)果如下:
1.中國患者的腫瘤類型分布情況
2.中國腫瘤患者體細胞基因改變的頻率
APC 和 KRAS 是導致結(jié)直腸癌發(fā)生突變的主要驅(qū)動突變,但在該檢測樣本范圍內(nèi)突變率略低于 TCGA 的顯示結(jié)果。
除 TP53外,在中國胃癌患者中未發(fā)現(xiàn)其它高頻突變。
CDH1 是我國第二高發(fā)的體細胞突變基因,其突變頻率與 TCGA 報道的相似 (9.63% vs 10%),但 CDH1 在 TCGA 的報道中并不是主要的驅(qū)動基因。
在肺鱗癌中,最常見的拷貝數(shù)改變 (CNV) 是 PIK3CA 的擴增和 CDKN2A 的丟失,與 TCGA 報道的差距不大。
在中國肺腺癌患者中,EGFR 突變的發(fā)生頻率為45.97%,TCGA 報道僅為14.35%;KRAS 的突變發(fā)生頻率為11.41%,TCGA 報道為32.61%。這說明,中國肺腺癌患者的發(fā)病原因與國外患者不同。
中國腫瘤患者CWES結(jié)果分析
對953份 CWES 報告進行分析,結(jié)果顯示88.56%的患者有至少一個臨床可操作的體細胞突變;約40%的患者至少攜帶四種潛在的免疫治療預測生物標志物中的一種;約20%的患者被推薦使用已獲得相應適應癥批準的分子靶向藥物。也就是說,CWES 報告能夠為絕大多數(shù)的腫瘤患者提供臨床治療建議。
CWES分析的臨床效益評估
對22例接受 CWES 檢測的中國患者進行長期跟蹤隨訪的結(jié)果顯示,遵循 CWES 分析結(jié)果接受后續(xù)治療的患者(A組)的中位無進展生存期 (PFS) 為12個月,較未遵循患者(B組)顯著延長,B組患者的中位PFS為4個月。45%的A組患者在這一輪治療中失敗了,而B組的失敗率為91%。
綜合以上的研究結(jié)果可以一定程度上說明 CWES 具有增加中國 IV 期腫瘤患者臨床獲益的潛力。這也是中國第一個評估 CWES 戰(zhàn)略臨床效益的研究。
與2016年相比,截至2018年11月,CFDA 共增加了15種抗腫瘤藥物,更多的藥物被納入了醫(yī)保,也使得中國腫瘤患者有了更多的藥物選擇。在這種背景下,更多的中國腫瘤患者可以得到基于 CWES 分析匹配的藥物,也期待臨床基因組測序技術(shù)的推廣能為更多腫瘤患者帶來切實的獲益。
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