腸道病毒crAssphage解鎖旅行打卡新技能

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來源：生物探索

2019-07-11

圣地亞哥州立大學(xué)的生物信息學(xué)研究員Rob Edwards教授帶領(lǐng)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，一種叫做crAssphage的腸道病毒存在于全球70%的人口中，是一種具有特定國家的生物標(biāo)志物。

旅行可以開拓眼界，也可以改變腸道結(jié)構(gòu)。

圣地亞哥州立大學(xué)的生物信息學(xué)研究員Rob Edwards教授帶領(lǐng)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，一種叫做crAssphage的腸道病毒存在于全球70%的人口中，是一種具有特定國家的生物標(biāo)志物。當(dāng)人類從一個(gè)地方旅行到另一個(gè)地方時(shí)，這種標(biāo)志物會(huì)迅速發(fā)生變化。他們的研究還表明，crAssphage的其它亞型生活在靈長類動(dòng)物中，可能與人類一起進(jìn)化了數(shù)百萬年。這是全球第一個(gè)針對(duì)病毒在人類微生物組中全球相似性的研究，結(jié)果發(fā)表在《Nature Microbiology》雜志上。

數(shù)字科學(xué)

Edwards和他的同事在2014年通過使用計(jì)算機(jī)軟件而不是培養(yǎng)皿分析糞便樣本發(fā)現(xiàn)了crAssphage的存在。這種數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的方法表明，crAssphage不僅是“一個(gè)良性的環(huán)球旅行者”，而且是“正常人類腸道病毒的一個(gè)組成部分”。

全球crAssphage 寶可夢

Edwards向科學(xué)界發(fā)出挑戰(zhàn)，邀請他們加入到對(duì)crAssphage的全球?qū)毿袆?dòng)中來。

反響非常熱烈：來自六大洲65個(gè)國家的117名研究人員、臨床醫(yī)生和學(xué)者共同分析了32,273種不同的crAssphage序列，發(fā)現(xiàn)crAssphage也被稱為噬菌體，是一種特異性感染細(xì)菌的病毒，是“人類腸道的世界性居民”。

這一發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵是由來自世界各地的志愿者組成的科學(xué)團(tuán)體，他們通過檢測本國污水處理廠、河流、湖泊和池塘的水，幫助實(shí)現(xiàn)了這一目標(biāo)。

助力個(gè)性化醫(yī)療

Edwards說：“這一發(fā)現(xiàn)說明了病毒如何在地球上傳播，并反映在我們的微生物群落中。我們才剛剛開始觸及表面，但最終，我們可能能夠操縱微生物群來攻擊有害細(xì)菌。這將是邁向個(gè)性化醫(yī)療的關(guān)鍵一步。”

參考資料：

[1] A common gut virus that maps our travels

[2] Global phylogeography and ancient evolution of the widespread human gut virus crAssphage

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