成本效益更高！基于DNA“包裝”模式的血液檢測(cè)讓7大癌癥現(xiàn)原形

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來(lái)源：生物探索

2019-06-10

如果有一種血液檢測(cè)能夠準(zhǔn)確檢測(cè)出乳腺癌、大腸癌、肺癌、卵巢癌、胰腺癌、胃癌或膽管癌等七大癌癥，并且方法更簡(jiǎn)單，價(jià)格更便宜，你愿意試一試嗎？

近日，美國(guó)約翰霍普金斯大學(xué)的研究人員開(kāi)發(fā)了一種簡(jiǎn)單的新型血液檢測(cè)方法（DELFI測(cè)試），通過(guò)發(fā)現(xiàn)癌細(xì)胞脫落的DNA碎片在血液中循環(huán)的獨(dú)特模式，可以檢測(cè)七種不同類型癌癥。這項(xiàng)研究發(fā)表在《自然》雜志網(wǎng)絡(luò)版上。

DELFI測(cè)試追蹤癌細(xì)胞

一般的血液檢測(cè)或者是“液體活組織檢查” 通常是尋找突變（癌細(xì)胞內(nèi)DNA突變），或?qū)ふ壹谆―NA甲基化）。但這類方法并不總是檢測(cè)所有癌癥患者都的癌細(xì)胞變化，早期檢測(cè)癌癥的方法仍然有很大的改進(jìn)空間。

DELFI測(cè)試通過(guò)觀察血液中來(lái)自基因組不同區(qū)域DNA的大小和數(shù)量，來(lái)研究DNA在細(xì)胞核內(nèi)的“包裝”方式以尋找癌細(xì)胞。

約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院Alessandro Leal表示：“與健康的細(xì)胞相比，癌細(xì)胞的細(xì)胞核更像是雜亂無(wú)章的手提箱，基因組被‘隨意堆放’。”

該研究的主要作者Jillian Phallen博士進(jìn)一步解釋說(shuō)：“由于各種原因，癌細(xì)胞基因組在包裝方式上是無(wú)序的，這意味著當(dāng)癌細(xì)胞死亡時(shí)，它們會(huì)以混亂的方式將DNA釋放到血液中。對(duì)這種游離DNA (cfDNA) 進(jìn)行檢測(cè)，DELFI測(cè)試可以偵查到基因組不同區(qū)域DNA的大小和數(shù)量的異?？梢詭椭R(shí)別癌癥。”

準(zhǔn)確判斷癌癥類型

如果該研究能夠得進(jìn)一步到驗(yàn)證，那就可以用于癌癥篩查。從一個(gè)人身上抽取一管血液，提取cfDNA并研究其基因序列的片段結(jié)構(gòu)。隨后，可以將來(lái)自該個(gè)體的全基因組cfDNA片段與健康人群進(jìn)行比較，以確定這些片段是健康的還是源自癌癥。

研究人員發(fā)現(xiàn)癌癥患者和健康個(gè)體的全基因組cfDNA片段呈現(xiàn)顯著不同。在癌癥患者體內(nèi), cfDNA中的片段模式是由血液和腫瘤細(xì)胞釋放的DNA混合物引起的，并且顯示出多種基因組差異。

研究的共同作者之一Robert B. Scharpf博士表示，DELFI能同時(shí)分析基因組中百萬(wàn)計(jì)的序列，揭示與特定組織相關(guān)的差異。這樣不僅能夠判斷片段是否來(lái)自癌癥，還能夠指出癌細(xì)胞的來(lái)源，像是來(lái)自乳腺癌，結(jié)腸癌或肺癌。

研究人員利用DELFI測(cè)試在208名患者體內(nèi)準(zhǔn)確檢測(cè)到癌癥DNA的存在。他們罹患的癌癥種類與癌癥程度各不相同。此外，DELFI測(cè)試在215名健康個(gè)體的血液樣本測(cè)試中表現(xiàn)也很不錯(cuò)，只有4例被誤診為癌癥。

研究人員說(shuō)，通過(guò)人工智能來(lái)識(shí)別癌癥患者血液中DNA片段的異常模式，我們可以在多達(dá)75%的病例中確定癌癥組織的起源。當(dāng)DELFI和基于突變的cfDNA分析相結(jié)合時(shí)，研究人員可以準(zhǔn)確地檢測(cè)出91％的癌癥患者。

總的來(lái)說(shuō)，健康的基因都是相似的，癌細(xì)胞的基因各有不同。

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