JAMA：基因檢測不是“靜態(tài)”的，近1/4“意義不確定突變”被重新分類

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作者：悠然來源：生物探索

2018-09-28

近日，一項(xiàng)回顧了145萬人的遺傳性癌癥基因測序結(jié)果的研究發(fā)現(xiàn)，近25%的“不確定重要性的突變”（variants of uncertain significance）之后被重新分類，其中大多數(shù)會降級為“良性”。

9月25日，《Journal of the American Medical Association》期刊發(fā)表了這一篇題為“Prevalence of Variant Reclassification Following Hereditary Cancer Genetic Testing”的文章。來自于德克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心的科學(xué)家們根據(jù)研究結(jié)果強(qiáng)烈建議：當(dāng)科學(xué)知識得到發(fā)展、基因被重新分類時(shí)，基因檢測實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該定期回顧其測序結(jié)果，并給醫(yī)生提供相關(guān)信息。

他們回顧145萬人的遺傳性癌癥基因檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn)，近25%的“不確定重要性的基因突變”隨后被重新分類——有些與癌癥相關(guān)的可能性較低，有些與癌癥相關(guān)的可能性較高。

基因突變源于細(xì)胞分裂，但是并不是所有的變異都與疾病有關(guān)，它們被分成“良性”、“可能良性”“不確定重要性的變異”、“可能致病”和“致病性的”。

“如果一個(gè)突變被重新歸類為致病性的，那么對于患者而言意義是不同的。”文章作者、內(nèi)科教授Theo Ross表示，“例如，如果患者攜帶一個(gè)Lynch綜合征突變基因，他們則需要一個(gè)不同的治療方案——在更早的年齡或者更頻繁的進(jìn)行結(jié)腸鏡檢查；又或者如果攜帶BRCA突變基因，患者或許會選擇預(yù)防性手術(shù)或者接受超聲檢查等。”

典型的基因約包含27000個(gè)堿基對（A-T，G-C），這些大量的堿基對意味著無數(shù)的潛在變異。隨著高通量腫瘤測序和胚系基因檢測的廣泛應(yīng)用，如何應(yīng)對臨床意義不明確的基因突變，是大家面臨的挑戰(zhàn)之一。“我們一直在獲取新的數(shù)據(jù)，可能會發(fā)現(xiàn)有遺傳易感性的新家庭，并從他們的DNA突變中學(xué)習(xí)到新的知識。” Theo Ross博士解釋道。

這項(xiàng)研究回顧了2006年-2016年間Myriad Genetics實(shí)驗(yàn)室以及西南醫(yī)學(xué)中心癌癥遺傳學(xué)項(xiàng)目的相關(guān)臨床數(shù)據(jù)?？傮w而言，24.9%的“不確定重要性的變異”被重新分類，其中大多數(shù)降級為良性。

這項(xiàng)研究提醒醫(yī)生需要知道關(guān)于基因突變的知識更新有多快，重新分類很常見。同時(shí)，獨(dú)立的商業(yè)型實(shí)驗(yàn)室需要定期檢查基因突變數(shù)據(jù)，并提醒醫(yī)生注意重新分類。即便從“不確定”重新分類為“良性”，對于病人來說也很重要，因?yàn)榭梢宰屗麄儼残摹?/p>

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