科學(xué)家解析一種基因變異的致癌風(fēng)險

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來源：中國科學(xué)報

2018-09-19

全球乳腺癌發(fā)病率自20世紀(jì)70年代末開始一直呈上升趨勢。美國8名婦女一生中就會有1人患乳腺癌。中國不是乳腺癌的高發(fā)國家，但不宜樂觀，近年我國乳腺癌發(fā)病率的增長速度卻高出高發(fā)國家1～2個百分點。

《自然》近日在線發(fā)表的一篇論文對數(shù)千種BRCA1的基因變異按功能進(jìn)行了更精確的分類。這些功能評分對乳腺癌和卵巢癌罹患風(fēng)險的基因檢測解讀或具有臨床意義。

BRCA1是一種人體腫瘤抑制基因，BRCA1失去功能的突變與易患早發(fā)型乳腺癌和卵巢癌有關(guān)。雖然已發(fā)現(xiàn)的BRCA1基因變異有數(shù)千種，但許多都被列為“意義未明的變異”，給患癌風(fēng)險評估帶來了巨大挑戰(zhàn)。

要弄清這些意義未明的變異，其中一個方法是檢測變異基因的表達(dá)是否具有恢復(fù)DNA修復(fù)的功能，這也是腫瘤抑制過程的一部分。美國華盛頓大學(xué)的Jay Shendure及同事運用基因組編輯技術(shù)，對BRCA1基因功能至關(guān)重要的13個外顯子上的近4000種單核苷酸變異（SNV）的功能進(jìn)行了評估，并在2000萬個人類單倍體（HAP1）細(xì)胞中進(jìn)行了后續(xù)細(xì)胞存活率測定。

最后，研究人員識別出了約300種會干擾表達(dá)的SNV以及400多種錯義突變的SNV（會導(dǎo)致蛋白質(zhì)的氨基酸序列改變），發(fā)現(xiàn)這些變異并無實際功能（不破壞基因的原有功能）。這些功能評分與已知的致病性變異或良性變異的臨床評估密切相關(guān)。

該團(tuán)隊指出，與其他細(xì)胞系相比，HAP1細(xì)胞系可能不是生理學(xué)上的模型，但與臨床評估的高度相關(guān)性驗證了數(shù)據(jù)。研究者肯定了功能評分對變異分類的重要價值，并認(rèn)為研究結(jié)果可直接應(yīng)用于BRCA1基因篩查的解讀。

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