今日,波士頓地區(qū)一家名為Arbor Biotechnologies的新銳公司走出隱匿模式,閃亮登場(chǎng)。在公司的創(chuàng)始人中,我們看到了CRISPR技術(shù)的先驅(qū)之一張鋒教授的名字。令人意外的是,這家公司的核心技術(shù)看似并非CRISPR,而是更偏人工智能的范疇。它有望將基因序列數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)功能直接掛起鉤來,用于新分子的發(fā)現(xiàn)。如果能大規(guī)模驗(yàn)證其可行性,那Arbor Biotechnologies將潛力無限。
為了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo),Arbor Biotechnologies打造了一個(gè)全新的發(fā)現(xiàn)平臺(tái),將人工智能、基因組測(cè)序、基因合成、以及高通量篩選融合到了一起,深度挖掘多肽及蛋白質(zhì)的自然遺傳多樣性,以求尋找到全新分子,用于改善人類健康。
據(jù)介紹,Arbor Biotechnologies的發(fā)現(xiàn)平臺(tái)能用實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)來驗(yàn)證計(jì)算機(jī)的預(yù)測(cè),再使用計(jì)算機(jī)的預(yù)測(cè)來指導(dǎo)實(shí)驗(yàn),形成一個(gè)良性循環(huán)。而其高通量篩選能力則能讓這家新銳公司快速推進(jìn)新分子的發(fā)現(xiàn)。
4名創(chuàng)始人中,有3名來自張鋒教授的實(shí)驗(yàn)室(圖片來源:Arbor Biotechnologies公司官網(wǎng))
盡管核心平臺(tái)不是CRISPR,但其第一個(gè)成果卻和CRISPR息息相關(guān)。在今日發(fā)表在《Molecular Cell》上的一項(xiàng)研究中,Arbor Biotechnologies的共同創(chuàng)始人之一,張鋒教授之前的學(xué)生David Scott博士利用這一平臺(tái),發(fā)現(xiàn)了一種叫做Cas13d的蛋白。它雖然屬于Cas13家族,但比其他成員的體積都要來得更小,這讓它在實(shí)際應(yīng)用上有著更大的潛力。研究人員們表明,它有望用于RNA的調(diào)控,以及高靈敏性的診斷。
“Cas13d效應(yīng)蛋白有較小的體型、靶向局限較少、也有模塊化的調(diào)控規(guī)則。這些特性將進(jìn)一步擴(kuò)大CRISPR的工具庫,用于RNA的調(diào)控和檢測(cè)。”論文中這樣寫道。
這一發(fā)現(xiàn)驗(yàn)證了其核心技術(shù)的可行性,也是這家新銳取得的首個(gè)里程碑。正如Scott博士所言:“Arbor革命性的平臺(tái)能加速生物分子的發(fā)現(xiàn)和性質(zhì)分析,幅度達(dá)多個(gè)數(shù)量級(jí)。”我們清楚地看到了對(duì)蛋白性質(zhì)進(jìn)行大規(guī)模評(píng)估和篩選的好處。
Cas13d蛋白是這家公司的首個(gè)成果(圖片來源:《Molecular Cell》)
這一平臺(tái)的潛力早早得到了投資人們的看好。去年6月,ARCH Venture Partners、Faridan Ventures、以及其他一些投資機(jī)構(gòu)就完成了對(duì)Arbor Biotechnologies的1560萬美元A輪投資。“Arbor杰出的科學(xué)團(tuán)隊(duì)和技術(shù)能力無疑會(huì)在廣泛的領(lǐng)域里帶來革命性的發(fā)現(xiàn)。ARCH很高興能支持這樣一家公司推進(jìn)計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物發(fā)現(xiàn)的邊界。” ARCH Venture Partners的董事總經(jīng)理Keith Crandell先生評(píng)論道。
我們祝賀Arbor Biotechnologies今日完成其平臺(tái)的概念性驗(yàn)證,也期待這家新銳能在新分子的發(fā)現(xiàn)上給我們帶來更多驚喜,加快新藥研發(fā)的進(jìn)程。
參考資料:
[1] Arbor Biotechnologies Discovers New CRISPR System Utilizing its Discovery Platform
[2] UPDATED: CRISPR pioneer Feng Zhang co-founds a ‘limitless’ biotech upstart with big plans for speeding new drug development
[3] Cas13d Is a Compact RNA-Targeting Type VI CRISPR Effector Positively Modulated by a WYL-Domain-Containing Accessory Protein
[4] Biotech startup co-founded by MIT’s Feng Zhang unveils new CRISPR tool
[5] Arbor Biotechnologies官方網(wǎng)站
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